Čo spôsobuje falošne pozitívnych na COVID-19, testovanie PCR v laboratóriach vo Veľkej Británii. Na polymerázovú reťazovú reakciu (PCR), ktorý sa používa na stanovenie prevalencie prípadov COVID-19, bol vyvíjaný veľký tlak. Tak si pozrieme čo o kvalite testovania napísal virológ, ktorý tam bol zamestnaný a ked upozornil šéfov na nedostatky, tak ho vyrazili z roboty.
Okrem dobre zdokumentovanej miery falošných pozitívov, pričom 0,8% testovaných ľudí bude falošne označených ako pozitívnych, aj keď test prebehne perfektne – existujú aj falošné pozitívy generované nadmernou citlivosťou testu, pokiaľ mal COVID-19 alebo iný koronavírus, ale už nie je infekčný, stále sa môže stať, že vylučujete malé zložky vírusu a máte pozitívny test. Toto riziko sa zvyšuje so zvyšujúcim sa počtom zosilňovacích cyklov.
Existuje však tretia príčina falošných pozitívov, ktorou je krížová kontaminácia medzi testovanými vzorkami,, takže pozitívna vzorka môže kontaminovať negatívnu a obe ich zmeniť na pozitívne.
Čo spôsobuje falošne pozitívnych na COVID-19
Čo píše virolog: Dobrovoľne som sa prihlásil do laboratória Lighthouse v Milton Keynes, jednom z hlavných testovacích laboratórií vo Veľkej Británii. Náborový proces bol prekvapivo laxný, náborový agent sa pýtal iba na to, či môžem robiť noci. Na môj prvý deň v laboratóriu – 6 júla th – došlo k poruche zariadenia, manipuláciu s nebezpečným vzorkami a zdravotné a bezpečnostné predpisy. To ma šokovalo, pretože tieto výpadky mohli znamenať nielen riziko krížovej kontaminácie, ale tiež mohli ohroziť bezpečnosť kohokoľvek, kto pracuje v laboratóriách COVID-19 v zariadení.
Po troch dňoch práce v laboratóriu a odhalení rôznych bezpečnostných výpadkov som kontaktoval Výkonný úrad pre zdravie a bezpečnosť (HSE) a povedal im o svojich obavách. Rozhodli sme sa, že tam budem pokračovať v práci, aby som zistil, čo ešte môžem zistiť, a potom odovzdám informácie o akomkoľvek porušení bezpečnosti a ochrany zdravia inšpektorovi HSE, ktorý mi poradil, ako mám pracovať a ako zostať v bezpečí.
HSE nikdy predtým nezažila túto situáciu, keď by niekto pracujúci v utajení v rámci organizácie prenášal porušenia bezpečnosti a ochrany zdravia v reálnom čase. Preťaženie skriniek s vreckami na vzorky s tampónom a nepotrebným vybavením bolo bohužiaľ bežným javom. Toto vystavuje operátora riziku vystavenia aerosólom obsahujúcim patogény unikajúce zo skriniek do laboratórneho prostredia a ohrozuje integritu vzoriek tampónov v skrini a riskuje ich kontamináciu vírusmi a vírusovými zložkami cirkulujúcimi v laboratóriu.
Usadzovanie nečistôt v skrinkách môže tiež narušiť integritu vzoriek. Neexistoval však plán vo vhodných intervaloch na úplné vyčistenie všetkých vnútorných povrchov skriniek. Laboratórium, v ktorom sa uskutočňoval test PCR v reálnom čase, sa na účely spracovania udržiavalo pod negatívnym tlakom, čo znamenalo, že do tejto miestnosti nemal vstupovať vzduch z iných oblastí a potenciálne kontaminovať test.
Problémy s krížovou kontamináciou však začali na začiatku procesu predtým, ako boli vzorky odvedené do laboratória PCR. Hlavnými príčinami krížovej kontaminácie je spôsob, akým verejnosť používa súpravy na výtery; kontaminácia vnútorných častí rúrok a viečka operátorom; a kontaminácia závitu skúmaviek so vzorkovým médiom, ako je uvedené nižšie. Tieto problémy zhoršuje zlá kvalita väčšiny skúmaviek / uzáverov na vzorky a zmiešavacích skúmaviek a uzáverov dodávateľov s viečkami, takže niektoré z nich nepasujú správne.
Nebezpečným postupom, ktorý som v laboratóriu pozoroval, bol prechod netesných rúrok na personál manipulujúci s kvapalinami, ktorý ich nevedomky vystavoval riziku a prispieval k riziku krížovej kontaminácie.
Keď som začal pracovať v laboratóriu, oslovil som niekoľkých vedúcich laboratórií o niektorých mojich obavách, ale po piatom pokuse som si uvedomil, že moje problémy sú ignorované, a vedel som, že sa zo mňa stáva len nepríjemnosť. Vtedy som sa rozhodol kontaktovať HSE. Koncom júla som povedal manažérovi UK Biocentra, že som veľmi rozrušený a znepokojený nebezpečnými postupmi, ktoré pozorujem. Neskôr v ten deň ma HR suspendoval z pracoviska.
Na stretnutí s manažérmi, aby som dostal „spätnú väzbu“, mi nielen potvrdili všetky moje obavy o zdravie a bezpečnosť opísané v správe, ktorú som pripravil pred stretnutím, ale ponúkli mi propagáciu, ktorá zahŕňala rôzne zodpovednosti za zdravie a bezpečnosť v COVID -19 testovacích laboratórií vrátane prípravy prezentácií a praktických cvičení pre nových zamestnancov, ako aj existujúcich pracovníkov COVID-19,
To bol pozitívny krok – alebo som si to aspoň myslel. Pracovníci biocentra vo Veľkej Británii sa však stávali čoraz nepriateľskejšími, čo mi sťažovalo vykonávanie nových povinností. Situácia sa prevalila 13. augusta, keď som školiacemu manažérovi povedal, že som bol v kontakte s HSE, a nasledujúci deň ma suspendoval HR. 18. augusta mi HR povedal, že som teraz pozastavený do ukončenia výsledku disciplinárneho konania a krivo ma obvinil z útoku na recepčnú.
V ten večer som zavolal na políciu, ktorá mi povedala, že k útoku nemohlo dôjsť, pretože neboli informovaní a oblasť príjmu je presýtená kamerovým systémom. Kontaktoval som HSE, aby som im povedal, čo sa stalo, a 24. augusta sa obrátilo na britské biocentrum. Dňa 25. augusta th som začal pracovať s BBC a Independento spoločnom vyšetrovaní s cieľom odhaliť nebezpečné pracovné postupy v laboratóriu.
6. októbra ma HSE informovala, že ukončila vyšetrovanie. Po tom, čo BBC formálne kontaktovala HSE, vydala vyhlásenie, v ktorom uviedla, že identifikovala päť závažných porušení právnych predpisov o ochrane zdravia a bezpečnosti v laboratóriu, ktoré zahŕňali nedostatočné školenie zamestnancov v oblasti bezpečnosti a ochrany zdravia a príliš úzko spolupracujúcich zamestnancov.
V ten večer som zavolal na políciu, ktorá mi povedala, že k útoku nemohlo dôjsť, pretože neboli informovaní a oblasť príjmu je presýtená kamerovým systémom. Kontaktoval som HSE, aby som im povedal, čo sa stalo, a 24. augusta sa obrátilo na britské biocentrum. Dňa 25. augusta th som začal pracovať s BBC a Independento spoločnom vyšetrovaní s cieľom odhaliť nebezpečné pracovné postupy v laboratóriu. 6. októbra ma HSE informovala, že ukončila vyšetrovanie, ale neopomenula mi zaslať nálezy. Po tom, čo BBC formálne kontaktovala HSE, vydala vyhlásenie, v ktorom uviedla, že identifikovala päť závažných porušení právnych predpisov o ochrane zdravia a bezpečnosti v laboratóriu, ktoré zahŕňali nedostatočné školenie zamestnancov v oblasti bezpečnosti a ochrany zdravia a príliš blízko spolupracujúcich zamestnancov.
Cough cough. I do not have ….cough cough cough and our vaccine is cough cough cough percent effective cough.
Cough. pic.twitter.com/W8xLX5JgPX
— Darth Putin (@DarthPutinKGB) November 20, 2020
Záverečné poznámky
V „čiernej skrinke“ v laboratóriách majáka je veľa neznámych, pričom vzorky tampónov vstupujú na jeden koniec a na druhý koniec výsledok testu COVID-19. Na indukcii, ktorej som sa zúčastnil, mi a ďalším novým zamestnancom povedali, aby mlčali, čo sa deje za týmito stenami.
Nezávislé vedecké hodnotenie laboratórií Lighthouse nie je možné z dôvodu nedostatku transparentnosti. Keď som požadoval informácie, ktoré mi mohli pomôcť posúdiť spoľahlivosť výsledkov testu – napríklad povahu primérov použitých pri teste – povedali mi, že ide o informácie, ktoré sú predmetom priemyselného vlastníctva, pretože testovacie zložky vyrába súkromná spoločnosť
Prístup k tomuto materiálu je v značnom verejnom záujme, pretože by nám povedal, či je testovanie COVID-19 v týchto laboratóriách vhodné na daný účel. Pomohlo by nám to predovšetkým určiť, do akej miery laboratóriá nafukujú podiel populácie, ktorá má infekciu COVID-19.
Oklamal SARS-CoV-2 celý svet?
Príspevok Mikka Paunia MD, MHS, pomocného profesora všeobecnej epidemiológie na Helsinskej univerzite. Mikko Paunio napísal dodatok k svojej práci s odkazom na množstvo prieskumov, ktoré boli zverejnené odvtedy, čo ich napísal, pričom sa zdá, že podporujú jeho hypotézu, že vírusu bolo vystavených oveľa viac ľudí, ako pôvodne odhadovala Svetová zdravotnícka organizácia. Najmenej 50% infikovaných ľudí je bez príznakov a že veľké mestá ako New York majú blízko k stádovej imunite.
Newyorsko-presbyteriánska Allenova nemocnica a Columbia University v Irving Medical Center implementovali univerzálne testovanie COVID-19 na tehotných ženách, ktoré boli prijaté do nemocnice na pôrod medzi 22. marcom a 4. aprílom. Boli testované na SARS-CoV-2 pomocou výterov z nosohltanu a kvantitatívnej PCR. Miera prevalencie, čiže prevahy protilátok SARS-CoV-2 bola 13,7% (26/215). Takmer všetky ženy boli bez príznakov. To znamená, že medzi tými, ktorí k nim mali prístup, bolo infikovaných veľmi veľké množstvo ľudí nemocnice v meste so spádovými oblasťami na Manhattane, kde je incidencia COVID-19 oveľa nižšia než v iných častiach NYC.
Podobné pôrodnícke informácie máme z rovnakého obdobia z Karolínskej nemocnice vo Švédsku. Tam boli všetky ženy (N = 320) prijaté do nemocnice na pôrod testované na SARS-CoV-2. Ukázalo sa že 7% bolo infikovaných SARS-CoV-2 bez príznakov. To je opäť kompatibilné s myšlienkou, že SARSCoV-2 sa rozšíril v populácii v Štokholme oveľa širšie, ako naznačovali.
3. 11. 2020
„Ďalšia pandémia bude pochádzať z oblasti Amazonky,“ tvrdí doktorka Alessandra Nava, vedkyňa z Manausu, ktorá sa venuje výskumu netopierov. Loví vírusy, ktoré číhajú v dažďových lesoch a môžu byť nebezpečné pre ľudí.
https://www.youtube.com/watch?v=FGAZeLGEYIY
Nedokončený príbeh – pomôžme rodine, ktorá náhle prišla o otca. Z plánov oslavy 50-ky môjho švagra sa odrazu organizoval jeho pohreb. Nikto to nečakal.